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Laboratoire de Génétique et Amélioration des Céréales (LGAC)

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Laboratoire de Génétique et Amélioration des Céréales (LGAC)

Responsable de structure: 

Hajer Slim Amara

Email de la structure: 

Présentation de la structure: 

Cette structure de recherche a été créée le 26 décembre 2001 et a été évaluée par le CNEAR à 4 reprises (2006, 2009, 2013 et 2019). Durant les 2 premiers mandats, nous avons développé 3 projets i) Amélioration de la tolérance des céréales aux stress abiotiques ii) Amélioration de la résistance des céréales aux stress biotiques et iii) Amélioration de la qualité technologique des céréales. Durant la période 2018-2021, 4 projets de recherche ont été développés i) Amélioration de la tolérance des céréales aux stress abiotiques, ii) Amélioration de la résistance des céréales aux stress biotiques, iii) Amélioration de l’efficience nutritionnelle des céréales face aux stress abiotiques et biotiques et iv) Amélioration de la qualité des céréales et valorisation du germoplasme autochtone pour promouvoir les produits de terroirs.

Concernant le mandat 2022-2025, la même ligne directrice a été  maintenue dans les mêmes objectifs. Durant ce dernier mandat, les activités de recherche du LR gravitent autour de  trois (03) projets.

 

Equipements et moyens scientifiques: 

Principaux équipements dont dispose le laboratoire :Hottes à flux laminaire (04)

  • Hottes à flux laminaire (04)
  • Chambre de culture (02)
  • Serre contrôlée compartimentée (01)
  • Incubateurs (03)
  • Autoclave grande capacité (01)  
  • Congélateur -20°C (01)
  • Spectrophotomètre (02)
  • Thermocycleur en temps réel (01)
  • Thermocycleur (01)
  • Etuves  (01)
  • Microscope à contraste de phase (01)
  • Centrifugeuse réfrigérée (01)
  • Electrophorèses verticales (02)+horizontale (01)
  • Etuve Memmert
  • Système de production d’eau ultrapure
  • InfracontSGrain Analyseur de la qualité
  • Thermo Scientific NanoDrop (01)
  • Micro-centrifugeuse (01)
  • Balance de Précision (03)
  • PH mètre V conductive (02)
  • Balance GRAM× FOCA (01)
  • Digesteur Kjeldahl azote (01)
  • Distillateur Kjeldahl azote (01)
  • Agitateur (02)
  • Stéréoscope Leica (02)

 

Thèmes de recherche: 

Projet 1 : Amélioration de la tolérance des céréales aux stress abiotiques

  • Responsable du programme : Youssef Trifa
  • Objectif : Approche intégrative pour l’identification et le développement de ressources génétiques céréalières adaptées aux changements climatiques.

Axe 1Phénotypage de germoplasmes céréaliers pour la tolérance aux stress abiotiques et biotiques

Axe 2 Développement de variétés adaptées aux stress par méthodes conventionnelles et  non conventionnelles (mutagénèse et culture cellulaire et tissulaire in vitro) notamment  la fixation des potentialités génétiques par l'utilisation de l’haplodiploïdisation

Axe 3Evaluation de l’efficience de l’utilisation des nutrients en interaction avec les stress abiotiques et biotiques

 

Projet 2 : Amélioration de la résistance des céréales aux maladies

  • Responsable du programme : Walid Hamada 
  • Objectif : Approche pluridisciplinaire pour la Gestion intégrée des systèmes céréaliers face aux stress abiotiques et biotiques

Axe 1 : Effet des composantes édaphiques et des pratiques agricoles sur la durabilité des systèmes céréaliers

Axe 2 : Valorisation des micro-organismes utiles et des extraits naturels en tant que stimulateurs de la croissance et de la défense naturelle des céréales

  • Axe 2.1 : Etude de l’aptitude à la mycohrization naturelle d’un panel de génotypes de blé dur, blé tendre et orge et de la diversité mycohrizienne et bactérienne associé à la rhizosphère et l’endosphère.
  • Axe 2.2 : Effet des microorganismes utiles et des plantes ou leurs extraits sur la protection contre les pathogènes (champignons et bactéries) et adventices (allélopathie) ainsi que la tolérance aux stress hydrique.

 

Projet 3 : Amélioration de la qualité des céréales et Valorisation du germoplasme autochtone pour promouvoir les produits de terroir

  • Responsable du programme : Amara Hajer
  • Objectif : Analyse intégrative des paramètres liés à la qualité technologique

Axe1: Effets des changements climatiques sur les paramètres agro-morphologiques, physiologiques et biochimiques liés à la qualité technologique des céréales

Axe 2 : Impact du mitadinage et des impuretés sur la qualité technologique du blé dur et analyse des mycotoxines

Axe 3 : Utilisation des variétés autochtones pour la valorisation des produits de terroir dans une optique de labellisation.

Equipe de recherche: 

Membres corps A : 08 ; Membres corps B : 06 ; Etudiants en cours de Thèse de Doctorat : 03 ;  Etudiants en cours de Mastère : 07

05 Corps équivalents

Membres permanents

Nom Prénom Grade Institution email Spécialité
Slim Amara Hajer  Professeur INAT

amarahajer@yahoo.fr

hajer.amara@inat.ucar.tn

Génétique et Amélioration des plantes

Hamada Walid Maître de conférences ESA/Kef w_hamada@yahoo.com Interactions plante-pathogène
Chérif Mejda Maître Assistant INAT cherif_majda@yahoo.fr Amélioration des plantes/Biotechnologie
Trifa Youssef Maître Assistant INAT youssef.trifa@gmail.com Biotechnologie/ Biologie moléculaire
Slama Olfa Maître Assistant INAT olfa.slama@planet.tn Biotechnologie/Culture in vitro
Torki Moez Maître Assistant INAT moeztorki@yahoo.fr Biotechnologie/ Biologie moléculaire
Sassi Khaled Maître de conférences INAT sassi_khaled5@yahoo.fr Agriculture durable
Ben Aissa Nadhira Maître Assistant INAT benaissa.nadhira@planet.tn Biologiques
Sciences du sol
Karmous Chahine Assistant ESA Mateur karmouschahine@yahoo.fr Agronomie/Amélioration des
plantes
Baraket Mokhtar Attaché de Recherche CRRGB Beja moktar.baraket@gmail.com Agronomie/Amélioration des plantes
         
Ines zouari Maître Assistant   ines.zouari28@gmail.com Agronomie et Fertilisation

 

Membres associés

Nom Prénom Grade Institution email Spécialité CV
Halim Belhaj Salah Maître de conférences INGC halimbhs@yahoo.com   CV14
Chedli Abdelli Professeur CBBC chedly.abdelly@gmail.com   CV15
Abdelwahed Ghorbel Professeur CBBC     CV16
Ali Sahli Maître Assistant INAT sahli_inat_tn@yahoo.fr   CV17
Patrick DuJardin Professeur Gembloux AgroBiotech- Belgique Patrick.duJardin@ulg.ac.be   CV18
Gilles Charmet Directeur
de Recherche
Université Blaise Pascal/INRA Clermont Ferrand – France gilles.charmet@clermont.inra.fr   CV19
Sergio Esposito Professeur Université degli Studi Di Napoli Federico II- Italie     CV20
Patrice Halama Professeur Université de Lille – France     CV21
Philippe Reignault Professeur Université de Callais – France     CV22
Samah Salim Maître de conférences Institut Polytechnique Lasalle Beauvais – France     CV23
Makram Belhaj Fraj Maître Assistant Centre International de l’Agriculture Biosaline Dubai-EAU belhaj_makram@yahoo.fr   CV24
José Louis Araus Professeur Université de Barcelone- Espagne     CV25

Doctorants  

Nom et prénom Email Directeur de Thèse Sujet CV
Tayachi Ons tayachi_ons@yahoo.fr Amara Hajer Gynogenèse et embryomgenèse somatique in vitro chez Hordeum Vulgare sous stress salin CV26
Babay Elyes e.babay@yahoo.fr Amara Hajer Approche biotechnologique pour l’évaluation et l’amélioration de la qualité technologique du blé dur CV27
Ayadi Sawsen sawsen.ayadi@gmail.com Rezgui Salah/
Trifa Youssef
Variabilité génotypique de l’efficience d’utilisation de l’azote chez le blé dur CV28
Slim Amine amine_slim_inat@yahoo.fr Amara Hajer Caractérisations morphologique, moléculaire et biochimique des populations autochtones de blé dur du Sud Tunisien CV29
Fériani Wissal wissalferiani@yahoo.fr Cherif Mejda Etude des interactions QTL x environnement associées aux paramètres agronomiques et à la résistance à Pyrenophora teres et au Rhynchosporium secalis chez l’orge CV30
Chamekh Zoubeir zoubeirchamek@gmail.com Amara Hajer/Trifa Youssef Evaluation de la tolérance du blé dur à l’irrigation par l’eau salée : Identification des marqueurs morpho-physiologique CV31
Somai Lamia lamia.somai@yahoo.fr Hamada Walid / Reignault Philippe Les stimulateurs de défenses naturelles vis-à-vis de la septoriose du blé tendre en France et du blé dur en Tunisie CV32
Boudabbous Khaoula khaoula_boudabbous@yahoo.fr Amara Hajer/Ben Aïssa Nadhira Effet de la salinité sur la relation entre et microorganismes édaphiques et les variétés améliorées et autochtines de blé dur durant leur cycle de développement CV33
Bouhaouel Imen imen_bouhaouel@hotmail.com Amara Hajer / DuJardin Patrick Analyse du potentiel allélopathique des orges  tunisiennes contre les adventices comme une réponse de défense et identification des allélochimiques d’intérêts CV34
Trad Hiba hibatrad@live.com Amara Hajer/Sassi Khaled Analyse qualitative et quantitative des sous unités de gluténines de hauts poids moléculaire (SG-HPM) pour l’identification de marqueurs biochimiques de qualité dans la descendance des croisements entre variétés tunisiennes autochtones et améliorées de blé dur CV35
Jeribi Rim rjeribi@yahoo.fr Amara Hajer Analyse et identification des mycotoxines (aflatoxines) chez les céréales sous l’effet des conditions de stockage CV36
Drissi Emna emna.drissi@yahoo.fr Amara Hajer /Gilles Charmet Analyse de la diversité génétique pour la tolérance à la sécheresse dans une core-collection mondiale de blé CV37
Hammami Zied hammamizied@live.fr Rezgui Salah/
Trifa Youssef
Etude de la variabilité morpho-physiologique et moléculaire d’une core collection d’orge (Hordeum vulgare L.) CV38

Mastère

Nom Prénom Email Directeur de mémoire Sujet CV
Jallouli Salma salmajallouli@gmail.com Trifa Youssef Analyse de la fiabilité de plusieurs méthodes de criblage pour la tolérance à la salinité chez le blé dur CV39
Rihab Touil   Ben Aissa Nadhira Erosion hydrique en agriculture de conservation et en agriculture conventionnelle: site de Tinja CV40
Abir Ben Hassine abir.benhassine@hotmail.fr Hamada Walid Mise au point de la reproduction sexuée en conditions contrôlées de Septoria tritici et recherche de spécificité parasitaire variétale sur le blé en Tunisie CV41
Zohra Maleh zohra_mellah@yahoo.fr Cherif Mejda Identification des QTLs liés aux paramètres biochimiques des grains d’orge CV42
Fatma Saghrouni saghrounifatma@gmail.com Cherif Mejda Etude de l’hérédité de la résistance de l’orge à la rayure réticulée et à la rhynchosporiose en utilisant des populations F3 issues des croisements Hordeum vulgare x Hordeum spontaneum CV43
Fedi Gudifi ghdififedi@hotmail.com Sassi Khaled Etude de l’effet de la mycorhization sur les paramètres agronomiques, physiologiques et de qualité technologique du blé dur conduit en mode biologique. CV44
Rim Belhaj Chedli belhadjchedlirim@yahoo.fr Sassi Khaled Identification et analyse d’expression de gènes de la voie d’assimilation de l’azote lors de la symbiose mycorhizienne chez le blé dur CV45
Emna Marouani   Ben Aïssa Nadhira Modélisation de la séquestration du carbone en agriculture de conservation CV46
Fatma Essid fatma_essid@yahoo.fr Trifa Youssef Possibilités d’intégration des marqueurs moléculaires pour le contrôle variétal de la collection de référence du maïs en France CV47
Bsaihia Naoufel naoufelbsaihia@gmail.com Trifa Youssef Etude de la régulation osmotique chez des variétés d'orge à tolérance à la salinité contrastée CV48
Mayssa Ben Jabeur maisouch@hotmail.fr Hamada Walid Efficacité des huiles essentielles dans le contrôle des maladies fongiques et leur modes d’actions CV49
Noura Mesaaed noura_0@live.fr Trifa Youssef Caractérisation des gènes impliqués dans la formation de fruits partheno-carpiques  chez Solanum lycopersicum CV50
Raouia Maamouri   Ben Aïssa Nadhira   CV51
Barbouchi Mariem   Ben Aïssa Nadhira   CV52

Projets: 

Appel d’offre Intitulé-Acronyme Période Lien
Optiwheat Application de la mutagénèse (TILLING) pour la création de variétés de blé dur tolérant à la sécheresse
(Resp : W. Hamada)
2004-2008 CEE (PCRD)
Tritimed Caractérisation de variétés de blé dur tolérantes à a sécheresse dans le bassin méditerranéen
(Resp : W. Hamada)
2006-2010 CEE (PCRD)
Farmers participatory breeding for salinity and drought tolerant double haploid wheat derived from mutation program TUN R0/ 13000  Identification and pyramiding of mutated genes : novel approaches for improving crop tolerance to salinity and drought 2005-2011  (AIEA)
Projet de Recherche Fédéré
Orge en pluvial et blé dur dans les périmètres irrigués dans les zones du Centre 
Sélection et valorisation de nouvelles sources de tolérance du blé dur à la salinité et d’orge à la sécheresse (Resp : H. Amara)  2009-2012  IRESA
Utilisation des biotechnologies pour l’amélioration génétique de l’orge aux maladies
Resp : M. Cherif)
2009-2012 IRESA
Projet de Recherche Fédéré
Orge dans le Sud
Valorisation d’accessions locale et introduite d’orge dans le sud (Resp : Y. Trifa) 2009-2012 IRESA
Global Crop Diversity Trust Farm Evaluation of Yield Potential of Local Durum Wheat Accessions Under Saline Irrigation (Resp : Y. Trifa) 2009-2012 (FAO)
Projet de collaboration bilatérale Tuniso_Egyptien Biochemical, molecular and field screening for salt tolerance of bread wheat cultivars and durum wheat irradiated mutants’.
.
2011-2014  

Partenariat: 

Notre laboratoire entretient des relations régulières avec des partenaires Nationaux dont : Institut National des Grandes Cultures (INGC) ; Centre Régional des Recherches en Grandes Cultures à Beja (CRRGB) ; INRGREF ; Centre de Biotechnologie de Borj Cedria (CBBC) ; INRAT ; Faculté des Sciences de Tunis ; INSAT ; CNSTN ; Laboratoire Central d’Analyse et d’Essais ; Office des Céréales ; Ecoles Supérieures d’Agriculture de Mateur / du Kef ; DG  de la Protection et Contrôle  de la Qualité des Produits Agricoles ; Coopératives des Semences ; OTD : CRDA ; BNG…  

Notre laboratoire travaillent en forte synergie avec des laboratoires de recherche étrangers tels que : ICARDA ; IAEA ; Agro-Bio Tech ULGembloux- Belgique ;  SupAgro Monpellier- France ; ISA Beauvais- France ;  Laboratoire de BioGAP/Institut Supérieur d'Agriculture/ ISA, Lille- France ; Mycologie UCEIV/ Université du Littoral Côte d'Opale/ULCO/Calais- France ; Université de Barcelone-Faculté de Biologie, Espagne.

Dans ce cadre, 3 conventions de thèse en cotutelle ont été signées : 

  • Lamia Somai Jemmali: Les stimulateurs de défenses naturelles vis-à-vis de la septoriose du blé tendre en France et du blé dur en Tunisie. (Directeurs de Thèse : W. Hamada/ INAT et Philippe Reignault/ Université de Calais – France).
  • Bouhaouel Imen: Analyse du potentiel allélopathique chez des orges tunisiennes (Hordeum vulgare ssp. vulgare) impliqué dans la réaction de défense contre des adventices et identification des allélochimiques. (Directeurs de Thèse : H. Slim Amara / INAT et Pr. Patrick du Jardin /Gembloux Agro-Bio Tech- Belgique).
  • Drissi Emna : Analyse de la diversité génétique pour la tolérance à la sécheresse dans une core-collection mondiale de blé (Directeurs de Thèse : H. Amara /INAT et G. Charmet/ Université Blaise Pascal/INRA Clermont Ferrand – France).

Production scientifique: 

Productions Scientifiques:

  • Publications Internationales dans des revues scientifiques indexées (à IF) : 40
  • Publications dans des revues indexées : 30
  • Communications Internationales (orales et par affiches) : 27+ 15 =42
  • Communications Nationales (orales et par affiches) : 23+4 = 27

Télécharger le fichier de la Productions Scientifiques depuis la Création du Laboratoire

Productions Académiques:

  • Thèses soutenues : 13         
  • Mastères soutenus: 60 
  • Thèses en cours : 13
  • Mastères en cours : 14

Télécharger le document de la production académique

Evénement: 

  • Organisation à l’INAT de 2 Ateliers pratiques Nationaux et 3 Journées scientifiques Internationales
  1. OGM, Agriculture et Biosécurité : 12 février 2008
  2. Les Applications des Biotechnologies pour l’Amélioration génétique du blé : 17 avril 2009
  3. Les Biotechnologies Végétales : Quels apports pour faire face aux changements climatiques ? : 14 octobre 2010.
  • Organisation d’ateliers pratiques sur l’utilisation des outils moléculaires en agriculture (PCR en temps réel)
  • Organisation de conférences internationales et nationales sur l’utilisation des biotechnologies végétales en agriculture

Ouverture sur l’environnement: 

Pour faire face au changement climatique, une des alternatives consiste à identifier de nouvelles sources de tolérance et d’adaptation. A cet effet, nos axes de recherche donnent une place de choix à l’évaluation du germoplasme autochtone céréalier ce qui témoigne de l’intérêt porté à ces ressources génétiques menacées d’extinction, dans le but de les valoriser et de les réhabiliter pour une meilleure exploitation dans les zones marginalisées, en mode biologique, ou alors  agriculture de conservation pour un meilleur respect de l’environnement.

Notre mission a aussi une teinte recherche- développement via le développement d’outils de diagnostique des maladies des céréales ainsi que le suivi de la campagne céréalière nationale avec les autorités compétentes. En matière de protection contre les maladies des journées d’informations et de vulgarisation sont organisées pour les agriculteurs en collaboration avec les centres techniques et des partenaires privés.

En matière de biosécurité, nous participons en tant que représentant de l’enseignement supérieur agricole dans la commission nationale qui cherche à évaluer les risques liés à l’utilisation en agriculture tunisienne des plants issus des biotechnologies végétales.