Responsable de structure:
Email de la structure:
Présentation de la structure:
Le Laboratoire de Génétique et Amélioration des Céréales (LR02AGR02) a été crée le 26 décembre 2001. Il a pour principal objectif l’amélioration de la tolérance du Blé et de l’Orge aux stress biotiques et abiotiques et pour leur qualité technologique par l’utilisation d’outils biotechnologiques. Ce programme vise l’analyse de diversité génétique du germoplasme autochtone et le développement de variétés tolérantes aux stress abiotiques (salinité et sécheresse) et aux stress biotiques principalement l’étude de la génétique de la résistance à la septoriose du blé ainsi qu’aux principales maladies de l’orge (helminthosporiose et rhynchosporiose). A cet effet, une approche est mise en place intégrant la mutagenèse induite, la culture in vitro (embryogenèse et haplodiploïdisation), l'utilisation de la cartographie génétique partielle ainsi que l’identification des QTLs.
Equipements et moyens scientifiques:
Principaux équipements dont dispose le laboratoire :
- Hottes à flux laminaire (04)
- Chambre de culture (02)
- Serre contrôlée compartimentée (01)
- Incubateurs (03)
- Autoclave grande capacité (02)
- Congélateur -80°C (01)
- Spectrophotomètre (01)
- Thermocycleur en temps réel (01)
- Thermocycleur (01)
- Etuves (01)
- Microscope à contraste de phase (01)
- Centrifugeuse réfrigérée (01)
- Electrophorèses verticales (02)+horizontale (01)
Thèmes de recherche:
Programme 1 : Amélioration de la tolérance des céréales aux stress abiotiques
Responsable du programme : Youssef Trifa
Ce programme vise la compréhension des mécanismes de tolérance aux stress hydriques et salin chez les céréales majeures (Blé tendre, blé dur et orge), ainsi que l’identification de lignées tolérantes. Ces lignées pourraient être utilisées comme géniteurs dans un programme de sélection ou inscrites au catalogue national en tant que variétés.
Mots clés : Stress abiotique ; Germoplasme Local ; Tilling ; Mutagénèse ; Culture in vitro
Programme 2 : Amélioration de la résistance des céréales aux maladies
Responsable du programme : Walid Hamada
Ce programme vise à trouver des solutions pour la protection des céréales contre les principales maladies fongiques et ce en étudiant les mécanismes d’interaction plante- pathogène pour des voies d’amélioration génétique et une contribution à une lutte plus efficiente contre les microorganismes pathogènes. Ce programme comporte deux volets principaux :
Etude de l’hérédité de la résistance de l’orge à la rayure réticulée et à la rhynchosporiose en utilisant des accessions d’orge sauvage (Hordeum spontaneum) ; Détermination des QTLs et des interactions QTL x environnement associés à la résistance à la rayure réticulée et à la rhynchosporiose ainsi qu’aux paramètres agronomiques.
Caractérisation de l’interaction blé-septoriose maladie fongique due au champignon pathogène Septoria tritici : mettre en évidence les facteurs de pathogénicité et élucider les mécanismes de défense de l’hôte suite à des applications de produits naturels éliciteurs.
Mots clés : Maladies fongiques ; Défense ; Interaction ; QTL x environnement
Programme 3 : Amélioration de la qualité des céréales
Responsable du programme : Amara Hajer
L’objectif général de ce programme vise la caractérisation agro-morphologique et biochimique du germoplasme local de blé dur et d’orge dans le but d’évaluer la diversité génétique présente, l’analyse des paramètres liés à la qualité ainsi que l’identification des QTLs notamment chez le blé dur et l’orge. Nous proposons également d’étudier l’impact de l’itinéraire technique, en particulier la fertilisation azotée, sur la qualité technologique.
Mots clés : Teneur en protéines ; gluténines ; gliadines ; teneur en amidon et en cellulose ; QTLs ; Efficience d’utilisation de l’azote.
Equipe de recherche:
Membres corps A : 4 ; Membres corps B : 8 ; Ingénieur : 1 Etudiants en cours de Thèse de Doctorat : 13 ; Etudiants en cours de Mastère : 8
Membres permanents
| Nom Prénom | Grade | Institution | Spécialité | CV | |
|---|---|---|---|---|---|
| Harrabi Moncef | Professeur | INAT | mohamedmoncef.harrabi@yahoo.com | Amélioration/Résistance aux maladies | CV1 |
| Daaloul Abderrazek | Professeur | INAT | adaaloul@yahoo.com | Amélioration des plantes | CV2 |
| Slim Amara Hajer | Professeur | INAT | amarahajer@yahoo.fr | Amélioration des plantes/Biotechnologie | CV3 |
| Hamada Walid | Maître de conférences | ESA/Kef | w_hamada@yahoo.com | Interactions plante-pathogène | CV4 |
| Chérif Mejda | Maître Assistant | INAT | cherif_majda@yahoo.fr | Amélioration des plantes/Biotechnologie | CV5 |
| Trifa Youssef | Maître Assistant | INAT | youssef.trifa@gmail.com | Biotechnologie/ Biologie moléculaire | CV6 |
| Slama Olfa | Maître Assistant | INAT | olfa.slama@planet.tn | Biotechnologie/Culture in vitro | CV7 |
| Torki Moez | Maître Assistant | INAT | moeztorki@yahoo.fr | Biotechnologie/ Biologie moléculaire | CV8 |
| Sassi Khaled | Maître de conférences | INAT | sassi_khaled5@yahoo.fr | Agriculture durable | CV9 |
| Ben Aissa Nadhira | Maître Assistant | INAT | benaissa.nadhira@planet.tn | Biologiques Sciences du sol |
CV10 |
| Karmous Chahine | Assistant | ESA Mateur | karmouschahine@yahoo.fr | Agronomie/Amélioration des plantes |
CV11 |
| Baraket Mokhtar | Attaché de Recherche | CRRGB Beja | moktar.baraket@gmail.com | Agronomie/Amélioration des plantes | CV12 |
| Besbes Raja | Ingénieur Principal |
INAT | Rajabesbes1@yahoo.fr | Sciences Production Végétale | CV13 |
Membres associés
| Nom Prénom | Grade | Institution | Spécialité | CV | |
|---|---|---|---|---|---|
| Halim Belhaj Salah | Maître de conférences | INGC | halimbhs@yahoo.com | CV14 | |
| Chedli Abdelli | Professeur | CBBC | chedly.abdelly@gmail.com | CV15 | |
| Abdelwahed Ghorbel | Professeur | CBBC | CV16 | ||
| Ali Sahli | Maître Assistant | INAT | sahli_inat_tn@yahoo.fr | CV17 | |
| Patrick DuJardin | Professeur | Gembloux AgroBiotech- Belgique | Patrick.duJardin@ulg.ac.be | CV18 | |
| Gilles Charmet | Directeur de Recherche |
Université Blaise Pascal/INRA Clermont Ferrand – France | gilles.charmet@clermont.inra.fr | CV19 | |
| Sergio Esposito | Professeur | Université degli Studi Di Napoli Federico II- Italie | CV20 | ||
| Patrice Halama | Professeur | Université de Lille – France | CV21 | ||
| Philippe Reignault | Professeur | Université de Callais – France | CV22 | ||
| Samah Salim | Maître de conférences | Institut Polytechnique Lasalle Beauvais – France | CV23 | ||
| Makram Belhaj Fraj | Maître Assistant | Centre International de l’Agriculture Biosaline Dubai-EAU | belhaj_makram@yahoo.fr | CV24 | |
| José Louis Araus | Professeur | Université de Barcelone- Espagne | CV25 |
Doctorants
| Nom et prénom | Directeur de Thèse | Sujet | CV | |
|---|---|---|---|---|
| Tayachi Ons | tayachi_ons@yahoo.fr | Amara Hajer | Gynogenèse et embryomgenèse somatique in vitro chez Hordeum Vulgare sous stress salin | CV26 |
| Babay Elyes | e.babay@yahoo.fr | Amara Hajer | Approche biotechnologique pour l’évaluation et l’amélioration de la qualité technologique du blé dur | CV27 |
| Ayadi Sawsen | sawsen.ayadi@gmail.com | Rezgui Salah/ Trifa Youssef |
Variabilité génotypique de l’efficience d’utilisation de l’azote chez le blé dur | CV28 |
| Slim Amine | amine_slim_inat@yahoo.fr | Amara Hajer | Caractérisations morphologique, moléculaire et biochimique des populations autochtones de blé dur du Sud Tunisien | CV29 |
| Fériani Wissal | wissalferiani@yahoo.fr | Cherif Mejda | Etude des interactions QTL x environnement associées aux paramètres agronomiques et à la résistance à Pyrenophora teres et au Rhynchosporium secalis chez l’orge | CV30 |
| Chamekh Zoubeir | zoubeirchamek@gmail.com | Amara Hajer/Trifa Youssef | Evaluation de la tolérance du blé dur à l’irrigation par l’eau salée : Identification des marqueurs morpho-physiologique | CV31 |
| Somai Lamia | lamia.somai@yahoo.fr | Hamada Walid / Reignault Philippe | Les stimulateurs de défenses naturelles vis-à-vis de la septoriose du blé tendre en France et du blé dur en Tunisie | CV32 |
| Boudabbous Khaoula | khaoula_boudabbous@yahoo.fr | Amara Hajer/Ben Aïssa Nadhira | Effet de la salinité sur la relation entre et microorganismes édaphiques et les variétés améliorées et autochtines de blé dur durant leur cycle de développement | CV33 |
| Bouhaouel Imen | imen_bouhaouel@hotmail.com | Amara Hajer / DuJardin Patrick | Analyse du potentiel allélopathique des orges tunisiennes contre les adventices comme une réponse de défense et identification des allélochimiques d’intérêts | CV34 |
| Trad Hiba | hibatrad@live.com | Amara Hajer/Sassi Khaled | Analyse qualitative et quantitative des sous unités de gluténines de hauts poids moléculaire (SG-HPM) pour l’identification de marqueurs biochimiques de qualité dans la descendance des croisements entre variétés tunisiennes autochtones et améliorées de blé dur | CV35 |
| Jeribi Rim | rjeribi@yahoo.fr | Amara Hajer | Analyse et identification des mycotoxines (aflatoxines) chez les céréales sous l’effet des conditions de stockage | CV36 |
| Drissi Emna | emna.drissi@yahoo.fr | Amara Hajer /Gilles Charmet | Analyse de la diversité génétique pour la tolérance à la sécheresse dans une core-collection mondiale de blé | CV37 |
| Hammami Zied | hammamizied@live.fr | Rezgui Salah/ Trifa Youssef |
Etude de la variabilité morpho-physiologique et moléculaire d’une core collection d’orge (Hordeum vulgare L.) | CV38 |
Mastère
| Nom Prénom | Directeur de mémoire | Sujet | CV | |
|---|---|---|---|---|
| Jallouli Salma | salmajallouli@gmail.com | Trifa Youssef | Analyse de la fiabilité de plusieurs méthodes de criblage pour la tolérance à la salinité chez le blé dur | CV39 |
| Rihab Touil | Ben Aissa Nadhira | Erosion hydrique en agriculture de conservation et en agriculture conventionnelle: site de Tinja | CV40 | |
| Abir Ben Hassine | abir.benhassine@hotmail.fr | Hamada Walid | Mise au point de la reproduction sexuée en conditions contrôlées de Septoria tritici et recherche de spécificité parasitaire variétale sur le blé en Tunisie | CV41 |
| Zohra Maleh | zohra_mellah@yahoo.fr | Cherif Mejda | Identification des QTLs liés aux paramètres biochimiques des grains d’orge | CV42 |
| Fatma Saghrouni | saghrounifatma@gmail.com | Cherif Mejda | Etude de l’hérédité de la résistance de l’orge à la rayure réticulée et à la rhynchosporiose en utilisant des populations F3 issues des croisements Hordeum vulgare x Hordeum spontaneum | CV43 |
| Fedi Gudifi | ghdififedi@hotmail.com | Sassi Khaled | Etude de l’effet de la mycorhization sur les paramètres agronomiques, physiologiques et de qualité technologique du blé dur conduit en mode biologique. | CV44 |
| Rim Belhaj Chedli | belhadjchedlirim@yahoo.fr | Sassi Khaled | Identification et analyse d’expression de gènes de la voie d’assimilation de l’azote lors de la symbiose mycorhizienne chez le blé dur | CV45 |
| Emna Marouani | Ben Aïssa Nadhira | Modélisation de la séquestration du carbone en agriculture de conservation | CV46 | |
| Fatma Essid | fatma_essid@yahoo.fr | Trifa Youssef | Possibilités d’intégration des marqueurs moléculaires pour le contrôle variétal de la collection de référence du maïs en France | CV47 |
| Bsaihia Naoufel | naoufelbsaihia@gmail.com | Trifa Youssef | Etude de la régulation osmotique chez des variétés d'orge à tolérance à la salinité contrastée | CV48 |
| Mayssa Ben Jabeur | maisouch@hotmail.fr | Hamada Walid | Efficacité des huiles essentielles dans le contrôle des maladies fongiques et leur modes d’actions | CV49 |
| Noura Mesaaed | noura_0@live.fr | Trifa Youssef | Caractérisation des gènes impliqués dans la formation de fruits partheno-carpiques chez Solanum lycopersicum | CV50 |
| Raouia Maamouri | Ben Aïssa Nadhira | CV51 | ||
| Barbouchi Mariem | Ben Aïssa Nadhira | CV52 |
Projets:
| Appel d’offre | Intitulé-Acronyme | Période | Lien |
|---|---|---|---|
| Optiwheat | Application de la mutagénèse (TILLING) pour la création de variétés de blé dur tolérant à la sécheresse (Resp : W. Hamada) |
2004-2008 | CEE (PCRD) |
| Tritimed | Caractérisation de variétés de blé dur tolérantes à a sécheresse dans le bassin méditerranéen (Resp : W. Hamada) |
2006-2010 | CEE (PCRD) |
| Farmers participatory breeding for salinity and drought tolerant double haploid wheat derived from mutation program TUN R0/ 13000 | Identification and pyramiding of mutated genes : novel approaches for improving crop tolerance to salinity and drought | 2005-2011 | (AIEA) |
| Projet de Recherche Fédéré Orge en pluvial et blé dur dans les périmètres irrigués dans les zones du Centre |
Sélection et valorisation de nouvelles sources de tolérance du blé dur à la salinité et d’orge à la sécheresse (Resp : H. Amara) | 2009-2012 | IRESA |
| Utilisation des biotechnologies pour l’amélioration génétique de l’orge aux maladies Resp : M. Cherif) |
2009-2012 | IRESA | |
| Projet de Recherche Fédéré Orge dans le Sud |
Valorisation d’accessions locale et introduite d’orge dans le sud (Resp : Y. Trifa) | 2009-2012 | IRESA |
| Global Crop Diversity Trust | Farm Evaluation of Yield Potential of Local Durum Wheat Accessions Under Saline Irrigation (Resp : Y. Trifa) | 2009-2012 | (FAO) |
| Projet de collaboration bilatérale Tuniso_Egyptien | Biochemical, molecular and field screening for salt tolerance of bread wheat cultivars and durum wheat irradiated mutants’. . |
2011-2014 |
Partenariat:
Notre laboratoire entretient des relations régulières avec des partenaires Nationaux dont : Institut National des Grandes Cultures (INGC) ; Centre Régional des Recherches en Grandes Cultures à Beja (CRRGB) ; INRGREF ; Centre de Biotechnologie de Borj Cedria (CBBC) ; INRAT ; Faculté des Sciences de Tunis ; INSAT ; CNSTN ; Laboratoire Central d’Analyse et d’Essais ; Office des Céréales ; Ecoles Supérieures d’Agriculture de Mateur / du Kef ; DG de la Protection et Contrôle de la Qualité des Produits Agricoles ; Coopératives des Semences ; OTD : CRDA ; BNG…
Notre laboratoire travaillent en forte synergie avec des laboratoires de recherche étrangers tels que : ICARDA ; IAEA ; Agro-Bio Tech ULGembloux- Belgique ; SupAgro Monpellier- France ; ISA Beauvais- France ; Laboratoire de BioGAP/Institut Supérieur d'Agriculture/ ISA, Lille- France ; Mycologie UCEIV/ Université du Littoral Côte d'Opale/ULCO/Calais- France ; Université de Barcelone-Faculté de Biologie, Espagne.
Dans ce cadre, 3 conventions de thèse en cotutelle ont été signées :
- Lamia Somai Jemmali: Les stimulateurs de défenses naturelles vis-à-vis de la septoriose du blé tendre en France et du blé dur en Tunisie. (Directeurs de Thèse : W. Hamada/ INAT et Philippe Reignault/ Université de Calais – France).
- Bouhaouel Imen: Analyse du potentiel allélopathique chez des orges tunisiennes (Hordeum vulgare ssp. vulgare) impliqué dans la réaction de défense contre des adventices et identification des allélochimiques. (Directeurs de Thèse : H. Slim Amara / INAT et Pr. Patrick du Jardin /Gembloux Agro-Bio Tech- Belgique).
- Drissi Emna : Analyse de la diversité génétique pour la tolérance à la sécheresse dans une core-collection mondiale de blé (Directeurs de Thèse : H. Amara /INAT et G. Charmet/ Université Blaise Pascal/INRA Clermont Ferrand – France).
Production scientifique:
Productions Scientifiques:
- Publications Internationales dans des revues scientifiques indexées (à IF) : 40
- Publications dans des revues indexées : 30
- Communications Internationales (orales et par affiches) : 27+ 15 =42
- Communications Nationales (orales et par affiches) : 23+4 = 27
Télécharger le fichier de la Productions Scientifiques depuis la Création du Laboratoire
Productions Académiques:
- Thèses soutenues : 13
- Mastères soutenus: 60
- Thèses en cours : 13
- Mastères en cours : 14
Evénement:
- Organisation à l’INAT de 2 Ateliers pratiques Nationaux et 3 Journées scientifiques Internationales
- OGM, Agriculture et Biosécurité : 12 février 2008
- Les Applications des Biotechnologies pour l’Amélioration génétique du blé : 17 avril 2009
- Les Biotechnologies Végétales : Quels apports pour faire face aux changements climatiques ? : 14 octobre 2010.
- Organisation d’ateliers pratiques sur l’utilisation des outils moléculaires en agriculture (PCR en temps réel)
- Organisation de conférences internationales et nationales sur l’utilisation des biotechnologies végétales en agriculture
Ouverture sur l’environnement:
Pour faire face au changement climatique, une des alternatives consiste à identifier de nouvelles sources de tolérance et d’adaptation. A cet effet, nos axes de recherche donnent une place de choix à l’évaluation du germoplasme autochtone céréalier ce qui témoigne de l’intérêt porté à ces ressources génétiques menacées d’extinction, dans le but de les valoriser et de les réhabiliter pour une meilleure exploitation dans les zones marginalisées, en mode biologique, ou alors agriculture de conservation pour un meilleur respect de l’environnement.
Notre mission a aussi une teinte recherche- développement via le développement d’outils de diagnostique des maladies des céréales ainsi que le suivi de la campagne céréalière nationale avec les autorités compétentes. En matière de protection contre les maladies des journées d’informations et de vulgarisation sont organisées pour les agriculteurs en collaboration avec les centres techniques et des partenaires privés.
En matière de biosécurité, nous participons en tant que représentant de l’enseignement supérieur agricole dans la commission nationale qui cherche à évaluer les risques liés à l’utilisation en agriculture tunisienne des plants issus des biotechnologies végétales.